Главная цель музея – углубление знаний студентов об истории университета, развитии медицины в Казахстане и мировых достижениях в области здравоохранения.

Экспозиция музея охватывает все этапы развития университета с момента его основания в 1930 году до наших дней. Залы музея последовательно демонстрируют основные организационные этапы развития как системы здравоохранения Казахстана, так и самого университета, ставшего важным центром подготовки высококвалифицированных медицинских специалистов.

Музей уделил особое внимание вкладу первых преподавателей и выпускников университета, чьи достижения в области медицины и науки сыграли значительную роль в формировании и развитии национальной системы здравоохранения.