Кафедраның клиникалық базасы 2011 ж. С.Д. Асфендияров атындағы ҚазҰМУнің № 2 Біріккен Университеттік Клиникасы болған. Ішкі аурулар Клиникасында тыныс алу ағзаларының аурулары бар науқастарға кеңес жүргізіліп, спирометрия әдісімен функционалды диагностика жүргізіліп, небулайзерлік терапия, оттегі терапия және тағы басқа әдістермен емдеулер жүргізілетін пульмонологиялық орталық ұйымдастырылды.