Клинические базы кафедры «Клиническая лабораторная диагностика» располагаются в НИИ кардиологии и внутренних болезней МЗ РК, городской клинической больнице №7, детской городской больнице № 2, научно-исследовательском кожно-венерологическом институте, и в университетских клиниках КазНМУ имени С.Д.Асфендиярова.