До 1952 года в КазГМИ действовала 5-летняя программа обучения, поэтому для студентов, переведенных со 2-го курса лечебного факультета, первые самостоятельные кафедры педиатрического цикла начали организовывать и назначать заведующих уже с августа 1939 года. Так, заведующим кафедрой пропедевтики детских болезней на педиатрическом факультете был избран кандидат медицинских наук Константин Федорович Попов, ранее работавший в должности главного врача детской поликлиники в г. Москве. Организатором клинический базы стала молодая ассистент А.И. Авенирова. Первоначально базой обучения была небольшая пристройка к детской консультации № 1 Фрунзенского района Алма-Аты по ул. Красина (ул. Валиханова) и угол ул. Пастера (ул. Макатаева). В пристройке консультации разместилось всего 25 коек, часть которых во время лекций временно сдвигалась, и дети выносились. Подробнее в «История организации первых педиатрических кафедр и подготовка детских врачей в КазНМУ (1938-1980)» https://kaznmu.kz/press/wp-content/uploads/2017/04/
С переходом на систему Болонского образования в 2006 году был осуществлен метод кредитных технологий для студентов. И вновь в 2014 году был создан Модуль «Особенности детского возраста» (руководитель модуля Измайлова С.Х., к.м.н., доцент) и утвержден решением Ученого Совета в качестве структурной единицы Протоколом №11 от 27.05.2014 года. Модуль в течение последующих двух лет осуществлял обучение студентов 3-го курса факультета «Общая медицина».
В октябре 2016 году Модуль был реорганизован в Курс №1 (заведующая курсом Абдуллаева Г.М., к.м.н., доцент), в связи с объединением всех кафедр педиатрического (за исключением инфекционного и хирургического) профиля, в единую Кафедру детских болезней. В 2016-2017 учебном году Курс №1 кафедры Детских болезней обеспечил обучение студентов 3 курсов факультета «Общая медицина» (ОМ) и «Международный Медицинский Факультет» (ММФ), на государственном, русском и английском языках. Обучение проводилось по кредитной технологии (циклы).
В сентябре 2017 года решением Ученого Совета Университета курс был преобразован в самостоятельную кафедру «Пропедевтики детских болезней» (заведующая кафедрой Измайлова С.Х., к.м.н., доцент).