Клиническими базами кафедры в разные годы были ЦГКБ, Городская клиническая больница №7 (ГКБ №7- Калкаман), Алматинская областная многопрофильная клиническая больница (АОМКБ), лечебно-диагностический центр (ЛДЦ). В настоящее время клинической базой кафедры является Городская клиническая больница №7 (ГКБ №7- Калкаман). Преподаватели кафедры владеют полным объемом оперативных вмешательств. 3 сотрудников кафедры имеют высшую категорию, 2- первую категории.
Кафедра тесно сотрудничает с врачами базовых клиник. Ежегодно проводятся совместные научно-практические конференции по актуальным вопросам хирургии. Ежегодно кафедра инициирует организацию заседания общества хирургов г. Алматы и Алматинской области, проводит выездные циклы по различным вопросам клинической медицины и медицинского образования. К 80-летию вуза кафедра организовала и провела заседание общества хирургов г. Алматы и Алматинской области в феврале 2013г.; заседание Общества хирургов г. Алматы и Алматинской области (26.05.2015, г. Алматы). Доклад на тему: «Хирургическое лечение перитонита и профилактика его осложнений». Докладчик проф. Муканов М.У.
Заседание Общества хирургов г. Алматы и Алматинской области (26.05.2015, г. Алматы). Доклад на тему: «Современные возможности лечения и профилактики спаечной болезни брюшины». Докладчик доцент Маленкова С.А.
Ко Дню Победы в Великой Отечественной войне кафедра ежегодно проводит бесплатный цикл консультаций.